:78 Function create_function() is deprecated [8192]

adding a whole timer for the IGR main script

Marcelo Ponce [2019-07-24 22:54:04]
adding a whole timer for the IGR main script
Filename
core/intergenic/det-interGenes.sh
diff --git a/core/intergenic/det-interGenes.sh b/core/intergenic/det-interGenes.sh
index 82623dc..f2aa14e 100755
--- a/core/intergenic/det-interGenes.sh
+++ b/core/intergenic/det-interGenes.sh
@@ -21,6 +21,12 @@

 #################################################

+
+### TIMERS... #################
+startTime=`date +%s`
+###############################
+
+
 # Setting preamble, detecting scripts location
 scriptsDIR=$( cd `dirname $0` && pwd )

@@ -105,4 +111,16 @@ t5=$(time paste  $interGENregions  `cat $SAMPLES | awk '{print "interGENs-"$1".c
 # statistics on running times
 echo Total time: $((Ttot+t5))

+
+### TIMERS... #################
+endTime=`date +%s`
+
+runtime=$((endTime-startTime))
+
+echo "-----------------------------"
+echo "Total runtime: $runtime secs"
+echo "-----------------------------"
+
+################################
+
 ###########################################################################
ViewGit